بدون شک یکی از مشکلات پرسپولیس در فصل جاری رقابت های لیگ برتر آماده نبودن بازیکنان از نظر شرایط بدنی است. انجام دو بازی با فواصل عجیب در رقابت های لیگ قهرمانان آسیا در شرایطی که دیگر تیم های لیگ برتری در حال انجام سخت ترین تمرینات بدنی و هوازی بودند باعث شد کادر فنی پرسپولیس رسما برای بازی با استقلال دوشنبه و الهلال دو بار به صورت جداگانه بدنسازی برای بازیکنان درنظر بگیرد و همین موضوع باعث شد سرخ پوشان به شکلی عجیب وارد لیگ برتر شوند.
در نهایت بدنسازی پرسپولیس به شکل کامل انجام نشد. اگرچه این موضوع تازه ای برای پرسپولیس نیست و سرخ ها به واسطه حضورهای پیاپی در آسیا طی سال های اخیر به نوعی آگاهی و شناخت کاملی از وضعیت موجود دارند اما در فصل جاری با توجه به تفاوتی که در نوع برگزاری رقابت ها وجود داشت، دچار مشکل شده اند.
خبرهای دریافتی از تیم پرسپولیس حکایت از آن دارد اولویت اول گل محمدی و دستیارانش در تمرینات فیفا دی، انجام تمرنیات بدنی، هوازی و رساندن بازیکنان به شرایط خوب بدنی است.