حضرت آیت‌الله خامنه‌ای در پیامی رحلت فقیه ربانی آیت‌الله سیدمحمد حسینی شاهرودی را تسلیت گفتند.
متن پیام رهبر انقلاب اسلامی به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
رحلت فقیه ربانی آیت‌الله آقای حاج سیّد محمّد شاهرودی را که از فقهای برجسته‌ی حوزه‌ی علمیه نجف و در سالهای پس از انقلاب ساکن قم بودند، به حوزه‌های قم و نجف و به عموم ارادتمندان و شاگردان آن مرحوم و بخصوص به آقازادگان و بازماندگان ایشان و وابستگان به بیت شریفِ والد ایشان مرحوم آیت‌الله العظمی شاهرودی از مراجع دوره‌ی قبل در نجف، تسلیت عرض میکنم و علو درجات و رحمت و مغفرت الهی را برای آن مرحوم مسألت مینمایم.
سیّدعلی خامنه‌ای
۱۸ تیر ۹۸
پیکر آیت الله سید محمد حسینی شاهرودی قبل از ظهر سه‌شنبه با حضور جمع کثیری از طلاب و شاگردان این عالم ربانی، اساتید سطوح عالی حوزه علمیه قم و اقشار مختلف مردم از مسجد امام حسن عسکری (ع) به سمت حرم کریمه اهل بیت (ع) تشییع شد.
در این مراسم آیت الله سید محمد سعیدی تولیت آستانه مقدسه حضرت معصومه (س)، تعدادی از نمایندگان مجلس خبرگان و اعضای جامعه مدرسین حوزه علمیه قم، نمایندگان بیوت مراجع تقلید، تعدادی از اعضای شورای نگهبان و جمعی از مسئولان قم حضور داشتند.
پس اقامه نماز توسط آیت الله سید حسین حسینی شاهرودی، پیکر این استاد سطوح عالی حوزه در حرم مطهر کریمه اهل بیت (ع) به خاک سپرده شد.
گفتنی است در پی رحلت فقیه ربانی مرحوم آیت‌الله سیدمحمد حسینی شاهرودی، مراسم بزرگداشتی از سوی حضرت آیت الله خامنه‌ای رهبر معظم انقلاب اسلامی امشب (سه شنبه شب) ۱۸ تیرماه ۱۳۹۸ بعد از نماز مغرب و عشاء در مسجد اعظم قم برگزار خواهد شد.
