در ابتدا هیات رئیسه سنی مجلس خبرگان در جایگاه قرار گرفت. در ردیف نخست صندلی های مجلس خبرگان، آیت‌الله محمد یزدی، آیت‌الله احمد جنتی، آیت‌الله محمدی گلپایگانی، آیت‌الله صادق لاریجانی ، حجت‌الاسلام حسن روحانی، آیت‌الله هاشمی رفسنجانی، آیت‌الله هاشمی شاهرودی و آیت‌الله موحدی کرمانی نشسته بودند. در این میان نام سید حسن خمینی نیز بر صندلی شماره 10 خودنمایی می‌کرد اما تا پایان جلسه خبری از حضور وی در مراسم افتتاحیه نشد.
از دیگر مدعوان جلسه اسحاق جهانگیری، سرلشگر فیروزآبادی ، سعید جلیلی ، آیت‌الله علم الهدی ، محمود احمدی‌نژاد، محسنی اژه ای، محمدباقر قالیباف ، حجت‌الاسلام مصطفی پورمحمدی ، محمد علی جعفری و علی اکبر صالحی بودند.
پس از آن آیت‌الله محمدی گلپایگانی ، پیام رهبر معظم انقلاب به پنجمین دوره مجلس خبرگان را قرائت کرد. رهبر انقلاب در پیام تبریکی که به اعضای پنجمین دوره مجلس خبرگان رهبری ارسال کردند، فرمودند: آغاز به کار پنجمین دوره‌ی مجلس خبرگان در ایّام ولادت حضرت ولیّ الله الاعظم ارواحنا فداه تقارن مبارکی است که باید به فال نیک گرفت و اطمینان به تسدید و تأیید الهی و رعایت و رضایتِ وَلَوی را در دلِ مؤمنِ به صدق وعده‌های الهی، افزون و پایدار ساخت. همچنین همزمانی با سوم خرداد را که نماد پیروزی مقاومت و افراشتن پرچم فتح و نصرت الهی است، باید قدر دانست و از آن پدیده‌ی شگفت‌آور، درس آموخت.خداوند عزیز و حکیم را با همه‌ی دل سپاس میگزارم که به ملت مؤمن و شجاع و باوفا توفیق تشکیل این مجلس را ارزانی فرمود و نظام جمهوری اسلامی را بار دیگر به بیعتی عمومی سرافراز ساخت. به شما برگزیدگان نیز به خاطر دستیابی به اعتماد و انتخاب ملت تبریک میگویم و توفیق در تقدیم خدمت شایسته به کشور و مردم را برای شما از خداوند علیم و بصیر مسألت میکنم. اهمیت این مجلس عظیم‌الشأن، ناشی از عظمت مسئولیتی است که بر دوش منتخب آن نهاده شده است. این مسئولیت در یک جمله: حراست دقیق و همه‌جانبه از هویت اسلامی و انقلابی نظام حاکم بر کشور و هدایت دستگاههای درهم‌تنیده‌ی این نظام به سمت هدفهای والا و عالیقدر آن است. ادای این مسئولیت سنگین نیازمند صلاحیتهائی است که در قانون اساسی به آن اشاره شده است. تشخیص وجود و بقای این صلاحیتها برعهده‌ی این مجلس معظم است و این به‌نوبه‌ی خود مسئولیتهای بزرگی را متوجه آن میسازد: آشنائی با جایگاه جمهوری اسلامی در دنیای کنونی؛ توجه به پدیده‌ی جذاب مردمسالاری دینی در میان انبوه شیوه‌های گوناگون حکومت که در آنها یا معنویت و دین، یا مردم، و یا هر دو قربانی شده‌اند؛ توجه به نقش بی‌مانند ایمان و باورهای برآمده از معارف اسلامی در نوع گزینشهای مردمی؛ توجه به تأثیر تقوای فردی و سیاسی شخص رهبر در حفظ اعتماد مردم و سلامت و صلابت و استواری نظام ... اینها بخشی از مسئولیتهای این مجلس معظم را که متشکل از فقهای مردمی و اثرگذار است، یادآور میشود و ادای آن را مطالبه میکند. هریک از سرفصلهای مذکور متضمن وظائفی است که حسن انجام آن، کشور و نظام را به صلاح و سداد رهنمون میگردد و رهبر را در ادای آن مسئولیت بزرگ و بی‌همتا مدد میرساند. توفیق شما حضرات محترم و خود را در پیمودن این مسیر مبارک که راه امام راحل بزرگوار و هدف بزرگ و حیاتی ایشان بود، از خداوند منان مسألت میکنم.
، آیت‌الله احمد جنتی برای ارائه گزارش خود از انتخابات پنجمین دوره مجلس خبرگان در جایگاه قرار گرفت و با اشاره به این که انتخابات دوره پنجم مجلس خبرگان در حالی برگزار شد که حساسیت‌ها و شرایط خاصی آن را احاطه کرده بود اظهار کرد: ما خدا را شاکریم که در کمال صحت و سلامت این انتخابات برگزار شد و رضایت مردم ور هبری را در پی داشت.
به محض پایان ارائه گزارش آیت‌الله جنتی از روند انتخابات مجلس خبرگان که با اظهار امیدواری وی از انجام دقیق وظایف اعضای این مجلس خاتمه یافت، مراسم تحلیف و قرائت سوگند نامه اعضای مجلس خبرگان در ساعت9:40 دقیقه آغاز شد و طی آن حجت‌الاسلام و المسلمین سید روح‌الله صدرالساداتی به عنوان منشی هیات رئیسه سنی در جایگاه حضور یافت و با قرائت متن سوگند نامه از اعضای خبرگان درخواست کرد که بایستند و جملات سوگند نامه را تکرار کند.
با آغاز مجدد جلسه، اعضای خبرگان در نخستین انتخاب شان با برگزیدن آیت‌الله احمد جنتی به عنوان پنجمین رئیس عمامه سفید این مجلس و نیز آیات موحدی کرمانی و هاشمی شاهرودی به عنوان نواب اول و دوم و در نهایت با رای به آیات خاتمی و دری نجف آبادی به عنوان دبیران اول و دوم، ترکیب کلی هیات رئیسه را تکمیل کردند.
